MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Streptobacillus moniliformis DSM 12112 plasmid pSMON01

Total Repeats: 42

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_013516	TAG	2	6	1949	1954	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_013516	T	8	8	1955	1962	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_013516	AAT	3	9	1991	1999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_013516	T	6	6	2018	2023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_013516	GTA	2	6	2035	2040	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_013516	GTT	2	6	2054	2059	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_013516	A	6	6	2080	2085	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_013516	TTA	2	6	2146	2151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_013516	TTTAT	2	10	2288	2297	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_013516	ATT	2	6	2302	2307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_013516	A	6	6	7958	7963	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_013516	T	6	6	7990	7995	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_013516	CTTT	2	8	8044	8051	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_013516	T	6	6	8064	8069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_013516	AT	3	6	8115	8120	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_013516	T	7	7	8126	8132	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_013516	ATC	2	6	8685	8690	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_013516	ACT	2	6	10148	10153	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_013516	TA	4	8	10163	10170	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_013516	A	6	6	10174	10179	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_013516	ATA	2	6	10211	10216	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_013516	T	6	6	10245	10250	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_013516	TATTT	2	10	10256	10265	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_013516	AATA	2	8	10290	10297	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_013516	ATTTT	2	10	10303	10312	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_013516	TGT	2	6	10331	10336	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_013516	ATAATT	2	12	10339	10350	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_013516	ATAG	2	8	10376	10383	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
29	NC_013516	CTAT	2	8	10392	10399	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
30	NC_013516	T	9	9	10399	10407	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_013516	TAA	2	6	10419	10424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_013516	T	7	7	10437	10443	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_013516	TAA	2	6	10474	10479	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_013516	A	8	8	10478	10485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_013516	TAT	2	6	10498	10503	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_013516	TAT	2	6	10508	10513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_013516	AAT	2	6	10514	10519	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_013516	ATATT	2	10	10525	10534	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_013516	TGC	2	6	10575	10580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_013516	T	6	6	10583	10588	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_013516	A	9	9	10647	10655	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_013516	A	6	6	10677	10682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.